+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+Szimuláció RBBGCMuso-val
Hollós Roland
2018. 09. 27
+
+
+Tartalomjegyzék
+ +1 Bevezetés
+2 Kérdésfeltevés
+3 RBBGCMuso használata
+
+
+3.1 devtools telepítése
+
+
+
+
+install.packages("devtools")
+
+3.2 RBBGCMuso telepítése
+
+
+
+devtools::install_github("hollorol/RBBGCMuso/RGBBCMuso")
+
+3.3 csomagok betöltése, munkakönyvtár beállítása:
+
+
+
+
+library(RBBGCMuso) +library(ggplot2) ++
3.4 futtatás előkészítése: setupMuso()
+
+
+
+
+beallitasok <- setupMuso()
+
+3.5 modellfuttatás: calibMuso()
+
+
+
+
+kimenet <- calibMuso(settings = beallitasok,skipSpinup=FALSE) +kimenet[1:6,1:2] ++
3.6 kimeneti adatok ábrázolása (első verzió)
+
+
+
+
+
+plot(kimenet[,"daily_gpp"])
+
+
+
+
+
+
3.7 egy kicsit cicomázva:
+
+
+
+
+
+par(mar=c(5,5,4,4)) +plot(y=kimenet[,"daily_gpp"], + x=as.Date(rownames(kimenet),"%d.%m.%Y"), xlab="Days", + ylab = expression(paste("daily GPP [",kg[C],m^-2,"]")), + type="l", col="blue", lwd="1.8") ++
+
+
+
+
3.8 Mindez sokkal egyszerűbben
+
+
+
+
+
+plotMuso(variable="daily_gpp")
+
+
+
+
+
+
3.9 Egy apró javítás
+
+
+
+
+
+plotMuso(variable="daily_gpp")+ + labs(y=expression(paste("daily GPP [",kg[C],m^-2,"]"))) ++
+
+
+
+
3.10 musoMappingFind()
+-
+
- Honnan tudjuk, hogy mi is egy általános változónak a neve?
+
-
+
- http://nimbus.elte.hu/bbgc/files/MUSO5b_variables.xlsx +
- musoMappingFind() függvény segítségével pl.: + +
+
+
3.11 musoMappingFind()
+
+
+
+
+musoMappingFind("yield")
+
+| 3037 | +cum_yieldC_HRV | +
3.12 Nézzük meg, hogy hogyan változott a termés 2013 és 2017 között!
+
+
+
+
+
+plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+ + labs(y=expression(paste("yield [",kg[C],m^-2,"]"))) ++
+
+
+
+
+
3.13 Mentsük el az alapábránkat!
+
+
+
+
+
+
+
+termesAlap <- plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+ + labs(y=expression(paste("yield [",kg[C],m^-2,"]"))) ++
3.14 Mentsük le a LAI-t is
+
+
+
+
+
+LAIAlap <- plotMuso(variable="proj_lai")+ + labs(y=expression( + paste("Levélfelületi index ",over(m^2,m^2)))) +LAIAlap ++
+
+
+