diff --git a/docs/index.html b/docs/index.html index 80da8f6..14364d3 100644 --- a/docs/index.html +++ b/docs/index.html @@ -38,14 +38,14 @@

Tartalomjegyzék

@@ -53,12 +53,12 @@
-

1 Bevezetés

+

1 Bevezetés

-

1.1 AgroMo használatának szintjei

+

1.1 AgroMo használatának szintjei

  1. AgroMo Lite
  2. AgroMo Spatial
    3. @@ -69,7 +69,7 @@
-

1.2 Az RBBGCMuso:

+

1.2 Az RBBGCMuso:

-

2 A workshop célja

+

2 A workshop célja

  1. modell futtatása,
  2. eredmények ábrázolása,
    3. @@ -96,7 +96,7 @@
-

3 A modell input-output kezelése

+

3 A modell input-output kezelése

@@ -114,7 +114,7 @@ - + @@ -141,7 +141,7 @@
-

3.1 Az ini file feladatai

+

3.1 Az ini file feladatai

  • Vezérlés
  • Helyspecifikus adatok szolgáltatása
    • @@ -151,11 +151,11 @@
-

3.2 Az epc file feladatai

+

3.2 Az epc file feladatai

-

3.3 További fájlok

+

3.3 További fájlok

  • Meteorológiai (mtc43)
  • CO2
    • @@ -167,20 +167,20 @@
-

4 Input adatok

+

4 Input adatok

-

4.1 Helyszín: Hegyhátsál

+

4.1 Helyszín: Hegyhátsál

-

4.2 Meteorológia

+

4.2 Meteorológia

-

4.3 Meteorológia: csapadék

+

4.3 Meteorológia: csapadék

meteorology1.png @@ -189,7 +189,7 @@

-

4.4 Meteorológia: nappali átlaghőmérséklet

+

4.4 Meteorológia: nappali átlaghőmérséklet

meteorology2.png @@ -200,11 +200,11 @@

-

5 Kérdések

+

5 Kérdések

    -
  1. Milyen hatásai lehetnek a termésre/GPP-re, illetve LAIRA a jövőbeli lehetséges klimatikus változásoknak?
    2. +
  2. Milyen hatásai lehetnek a termésre/GPP-re, illetve LAI-ra a jövőbeli lehetséges klimatikus változásoknak?
  3. Mennyi műtrágyát használjunk?
    4. -
  4. Adott helyen milyen ökofiziológiai paraméterrel bíró (kukorica/búza/\(\dots\))fajtákat érdemes termesztenünk?
    5. +
  5. Adott helyen milyen ökofiziológiai paraméterrel bíró (kukorica/búza/\(\dots\)) fajtákat érdemes termesztenünk?
@@ -212,44 +212,44 @@
-

6 RBBGCMuso használata

+

6 RBBGCMuso használata

-

6.1 devtools telepítése

+

6.1 devtools telepítése

-
install.packages("devtools")
+
install.packages("devtools")
-

6.2 RBBGCMuso telepítése

+

6.2 RBBGCMuso telepítése

-
devtools::install_github("hollorol/RBBGCMuso/RGBBCMuso")
+
devtools::install_github("hollorol/RBBGCMuso/RGBBCMuso")
-

6.3 csomagok betöltése, munkakönyvtár beállítása:

+

6.3 csomagok betöltése, munkakönyvtár beállítása:

-
library(RBBGCMuso)
-library(ggplot2)
+
library(RBBGCMuso)
+library(ggplot2)
-

6.4 futtatás előkészítése: setupMuso()

+

6.4 futtatás előkészítése: setupMuso()

-
beallitasok <- setupMuso()
+
beallitasok <- setupMuso()
@@ -259,10 +259,10 @@
-

6.5 modellfuttatás: calibMuso()

+

6.5 modellfuttatás: calibMuso()

-
kimenet <- calibMuso(settings = beallitasok,skipSpinup=TRUE)
+
kimenet <- calibMuso(settings = beallitasok,skipSpinup=TRUE)
 round(kimenet[1:6,1:2],digits=2)
@@ -316,10 +316,10 @@ round(kimenet[1:6,1:2],digits=2)
-

6.6 kimeneti adatok ábrázolása (első verzió)

+

6.6 kimeneti adatok ábrázolása (első verzió)

-
plot(kimenet[,"daily_gpp"])
+
plot(kimenet[,"daily_gpp"])
@@ -331,14 +331,14 @@ round(kimenet[1:6,1:2],digits=2)
-

6.7 Ügyelvén az esztétikára:

+

6.7 Ügyelvén az esztétikára:

-
par(mar=c(2.2,5,1.5,0.5))
-plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-     x=as.Date(rownames(kimenet),"%d.%m.%Y"), xlab="",
-     ylab = expression(paste("daily GPP [",kgC,m^-2,"]")),
-     type="l", col="blue", lwd="1.8")
+
par(mar=c(2.2,5,1.5,0.5))
+plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
+     x=as.Date(rownames(kimenet),"%d.%m.%Y"), xlab="",
+     ylab = expression(paste("daily GPP [",kgC,m^-2,"]")),
+     type="l", col="blue", lwd="1.8")
@@ -350,10 +350,10 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.8 Mindez sokkal egyszerűbben

+

6.8 Mindez sokkal egyszerűbben

-
plotMuso(variable="daily_gpp")
+
plotMuso(variable="daily_gpp")
@@ -365,11 +365,11 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.9 Egy apró javítás

+

6.9 Egy apró javítás

-
plotMuso(variable="daily_gpp")+
-  labs(y=expression(paste("daily GPP [",kgC,m^-2,"]")))
+
plotMuso(variable="daily_gpp")+
+  labs(y=expression(paste("daily GPP [",kgC,m^-2,"]")))
@@ -381,7 +381,7 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.10 musoMappingFind()

+

6.10 musoMappingFind()

  • Honnan tudjuk, hogy mi is egy általános változónak a neve?
      @@ -393,10 +393,10 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.11 musoMappingFind()

+

6.11 musoMappingFind()

-
musoMappingFind("yield")
+
musoMappingFind("yield")
@@ -418,11 +418,11 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.12 Nézzük meg, hogy hogyan változott a termés 2013 és 2017 között!

+

6.12 Nézzük meg, hogy hogyan változott a termés 2013 és 2017 között!

-
plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+
-  labs(y="Termés [t/ha]")
+
plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+
+  labs(y="Termés [t/ha]")
@@ -434,11 +434,11 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.13 Ábrázoljuk inkább az éves maximumokat!

+

6.13 Ábrázoljuk inkább az éves maximumokat!

-
plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV", timeFrame="year", groupFun=max)+
-  labs(y="Termés [t/ha]")
+
plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV", timeFrame="year", groupFun=max)+
+  labs(y="Termés [t/ha]")
@@ -450,22 +450,22 @@ plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-

6.14 mentsük el az alapábránkat!

+

6.14 mentsük el az alapábránkat!

-
termesAlap <- plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV", timeFrame="year", groupFun=max)+
-    labs(y="Termés [t/ha]")
+
termesAlap <- plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV", timeFrame="year", groupFun=max)+
+    labs(y="Termés [t/ha]")
-

6.15 Nézzük meg, majd mentsük le a LAI-t is!

+

6.15 Nézzük meg, majd mentsük le a LAI-t is!

-
LAIAlap <- plotMuso(variable="proj_lai")+
+
LAIAlap <- plotMuso(variable="proj_lai")+
   labs(y=expression(
-    paste("Levélfelületi index ",m^2m^-2)))
+    paste("Levélfelületi index ",m^2m^-2)))
 LAIAlap
@@ -478,11 +478,11 @@ LAIAlap
-

6.16 GPP alap

+

6.16 GPP alap

-
GPPAlap <- plotMuso(variable="daily_gpp")+
-    labs(y=expression(paste("daily GPP [",kgC,m^-2,"]")))
+
GPPAlap <- plotMuso(variable="daily_gpp")+
+    labs(y=expression(paste("daily GPP [",kgC,m^-2,"]")))
 GPPAlap
@@ -495,29 +495,29 @@ GPPAlap
-

6.17 Gyep Biomassza

+

6.17 Gyep Biomassza

-
termesAlap_gyep <- plotMuso(variable = "leafc",
-    timeFrame = "year", groupFun=sum, skipSpinup=FALSE)
+
termesAlap_gyep <- plotMuso(variable = "leafc",
+    timeFrame = "year", groupFun=sum, skipSpinup=FALSE)
-

6.18 Gyep LAI

+

6.18 Gyep LAI

-
LAIAlap_gyep <- plotMuso(variable = "proj_lai", skipSpinup=FALSE)
+
LAIAlap_gyep <- plotMuso(variable = "proj_lai", skipSpinup=FALSE)
-

6.19 Gyep GPP

+

6.19 Gyep GPP

-
GPPAlap_gyep<-plotMuso(variable = "daily_gpp")
+
GPPAlap_gyep<-plotMuso(variable = "daily_gpp")
@@ -525,12 +525,12 @@ GPPAlap
-

7 Kísérletek

+

7 Kísérletek

-

7.1 Vetési idő

+

7.1 Vetési idő

iniMod.png @@ -538,13 +538,13 @@ GPPAlap

-

7.2 Vetési idő- Termés

+

7.2 Vetési idő- Termés

-
TermesValtozas_vetesido <- termesAlap+
-plotMuso(variable = "cum_yieldC_HRV",
-timeFrame = "year", groupFun=max,
-colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
TermesValtozas_vetesido <- termesAlap+
+plotMuso(variable = "cum_yieldC_HRV",
+timeFrame = "year", groupFun=max,
+colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 TermesValtozas_vetesido
@@ -557,12 +557,12 @@ TermesValtozas_vetesido
-

7.3 Vetési idő- LAI

+

7.3 Vetési idő- LAI

-
LAIValtozas_vetesido <- LAIAlap+
-plotMuso(variable = "proj_lai",
-colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
LAIValtozas_vetesido <- LAIAlap+
+plotMuso(variable = "proj_lai",
+colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 LAIValtozas_vetesido
@@ -575,12 +575,12 @@ LAIValtozas_vetesido
-

7.4 Vetési idő- GPP

+

7.4 Vetési idő- GPP

-
GPPValtozas_vetesido <- GPPAlap + 
-plotMuso(variable = "daily_gpp",
-colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
GPPValtozas_vetesido <- GPPAlap + 
+plotMuso(variable = "daily_gpp",
+colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 GPPValtozas_vetesido
@@ -593,7 +593,7 @@ GPPValtozas_vetesido
-

7.5 Műtrágyázás

+

7.5 Műtrágyázás

iniMod1.png @@ -602,13 +602,13 @@ GPPValtozas_vetesido

-

7.6 Műtrágyázás- Termés

+

7.6 Műtrágyázás- Termés

-
TermesValtozas_fertilP <- termesAlap+
-plotMuso(variable = "cum_yieldC_HRV",
-timeFrame = "year", groupFun=max,
-colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
TermesValtozas_fertilP <- termesAlap+
+plotMuso(variable = "cum_yieldC_HRV",
+timeFrame = "year", groupFun=max,
+colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 TermesValtozas_fertilP
@@ -621,12 +621,12 @@ TermesValtozas_fertilP
-

7.7 Műtrágyázás - LAI

+

7.7 Műtrágyázás - LAI

-
LAIValtozas_fertilP <- LAIAlap+
-plotMuso(variable = "proj_lai",
-colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
LAIValtozas_fertilP <- LAIAlap+
+plotMuso(variable = "proj_lai",
+colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 LAIValtozas_fertilP
@@ -639,12 +639,12 @@ LAIValtozas_fertilP
-

7.8 Műtrágyázás - GPP

+

7.8 Műtrágyázás - GPP

-
GPPValtozas_fertilP <- GPPAlap + 
-plotMuso(variable = "daily_gpp",
-colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
GPPValtozas_fertilP <- GPPAlap + 
+plotMuso(variable = "daily_gpp",
+colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 GPPValtozas_fertilP
@@ -657,13 +657,13 @@ GPPValtozas_fertilP
-

7.9 Szárazodás - Termés

+

7.9 Szárazodás - Termés

-
TermesValtozas_szarazodas <- termesAlap_gyep+
-  plotMuso(variable = "leafc",
-  timeFrame = "year", groupFun=sum,
-  colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
TermesValtozas_szarazodas <- termesAlap_gyep+
+  plotMuso(variable = "leafc",
+  timeFrame = "year", groupFun=sum,
+  colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 TermesValtozas_szarazodas
@@ -676,12 +676,12 @@ TermesValtozas_szarazodas
-

7.10 Szárazodás - LAI

+

7.10 Szárazodás - LAI

-
LAIValtozas_szarazodas <- LAIAlap_gyep+
-  plotMuso(variable = "proj_lai",
-  colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
LAIValtozas_szarazodas <- LAIAlap_gyep+
+  plotMuso(variable = "proj_lai",
+  colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 LAIValtozas_szarazodas
@@ -695,12 +695,12 @@ LAIValtozas_szarazodas
-

7.11 Szárazodás - GPP

+

7.11 Szárazodás - GPP

-
GPPValtozas_szarazodas <- GPPAlap_gyep + 
-  plotMuso(variable = "daily_gpp",
-  colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
+
GPPValtozas_szarazodas <- GPPAlap_gyep + 
+  plotMuso(variable = "daily_gpp",
+  colour = "brown", layerPlot = TRUE, skipSpinup=FALSE)
 GPPValtozas_szarazodas
@@ -715,22 +715,22 @@ GPPValtozas_szarazodas
-

8 AgroMo-Lite

+

8 AgroMo-Lite

-

8.1 Telepítés

+

8.1 Telepítés

-
setwd("../hegyhatsal")
+
setwd("../hegyhatsal")
-
intall_github("hollorol/AgroMoLite")
-library(AgroMoLite)
+
intall_github("hollorol/AgroMoLite")
+library(AgroMoLite)
@@ -744,7 +744,7 @@ GPPValtozas_szarazodas
-

8.2 Köszönöm, hogy itt voltak!

+

8.2 Köszönöm, hogy itt voltak!

meteorológia (mtc43)széntárazók állapotaiszéntározók állapotai