diff --git a/.gitmodules b/.gitmodules deleted file mode 100644 index f55664e..0000000 --- a/.gitmodules +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -[submodule "docs/reveal.js"] - path = docs/reveal.js - url = https://github.com/hakimel/reveal.js.git diff --git a/docs/hegyhatsal/daily_1.jpg b/docs/hegyhatsal/daily_1.jpg deleted file mode 100644 index 8361364..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/daily_1.jpg and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/daily_1.png b/docs/hegyhatsal/daily_1.png deleted file mode 100644 index a8be5c7..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/daily_1.png and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/daily_2.png b/docs/hegyhatsal/daily_2.png deleted file mode 100644 index 97849b9..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/daily_2.png and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/daily_3.png b/docs/hegyhatsal/daily_3.png deleted file mode 100644 index 1cb175f..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/daily_3.png and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/daily_4.png b/docs/hegyhatsal/daily_4.png deleted file mode 100644 index 0519481..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/daily_4.png and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/daily_5.png b/docs/hegyhatsal/daily_5.png deleted file mode 100644 index 001b252..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/daily_5.png and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/lai_base.png b/docs/hegyhatsal/lai_base.png deleted file mode 100644 index c316a4e..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/lai_base.png and /dev/null differ diff --git a/docs/hegyhatsal/yield_base.png b/docs/hegyhatsal/yield_base.png deleted file mode 100644 index 001b252..0000000 Binary files a/docs/hegyhatsal/yield_base.png and /dev/null differ diff --git a/docs/index.html b/docs/index.html deleted file mode 100644 index 4bbc1a3..0000000 --- a/docs/index.html +++ /dev/null @@ -1,294 +0,0 @@ - - - - -Szimuláció RBBGCMuso-val - - - - - - - - - - - -
-
-

Szimuláció RBBGCMuso-val

Hollós Roland

2018. 09. 27

-
-
- -
- -
-
-

1 Bevezetés

-
-
-
-
-

2 Kérdésfeltevés

-
-
-
-
-

3 RBBGCMuso használata

-
-
-
-
-

3.1 devtools telepítése

-
- -
install.packages("devtools")
-
-
- -
-
-

3.2 RBBGCMuso telepítése

-
- -
devtools::install_github("hollorol/RBBGCMuso/RGBBCMuso")
-
-
-
-
-

3.3 csomagok betöltése, munkakönyvtár beállítása:

-
- -
library(RBBGCMuso)
-library(ggplot2)
-
-
- -
-
-

3.4 futtatás előkészítése: setupMuso()

-
- -
beallitasok <- setupMuso()
-
-
- -
-
-

3.5 modellfuttatás: calibMuso()

-
- -
kimenet <- calibMuso(settings = beallitasok,skipSpinup=FALSE)
-kimenet[1:6,1:2]
-
-
- -
-
-

3.6 kimeneti adatok ábrázolása (első verzió)

-
- -
plot(kimenet[,"daily_gpp"])
-
-
- - -
-

daily_1.png -

-
- -
-
-

3.7 egy kicsit cicomázva:

-
- -
par(mar=c(5,5,4,4))
-plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-     x=as.Date(rownames(kimenet),"%d.%m.%Y"), xlab="Days",
-     ylab = expression(paste("daily GPP [",kg[C],m^-2,"]")),
-     type="l", col="blue", lwd="1.8")
-
-
- - -
-

daily_2.png -

-
- -
-
-

3.8 Mindez sokkal egyszerűbben

-
- -
plotMuso(variable="daily_gpp")
-
-
- - -
-

daily_3.png -

-
- -
-
-

3.9 Egy apró javítás

-
- -
plotMuso(variable="daily_gpp")+
-    labs(y=expression(paste("daily GPP [",kg[C],m^-2,"]")))
-
-
- - -
-

daily_4.png -

-
- -
-
-

3.10 musoMappingFind()

- -
-
-

3.11 musoMappingFind()

-
- -
musoMappingFind("yield")
-
-
- - - - --- -- - - - - - - -
3037cum_yieldC_HRV
- -
-
-

3.12 Nézzük meg, hogy hogyan változott a termés 2013 és 2017 között!

-
- -
plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+
-    labs(y=expression(paste("yield [",kg[C],m^-2,"]")))
-
-
- - -
-

yield_base.png -

-
- - -
-
-

3.13 Mentsük el az alapábránkat!

-
- -
termesAlap <- plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+
-    labs(y=expression(paste("yield [",kg[C],m^-2,"]")))
-
-
- - - - -
-
-

3.14 Mentsük le a LAI-t is

-
- -
LAIAlap <- plotMuso(variable="proj_lai")+
-    labs(y=expression(
-             paste("Levélfelületi index ",over(m^2,m^2))))
-LAIAlap
-
-
- - -
-

lai_base.png -

-
-
-
-
-
- - - - - - diff --git a/docs/reveal.js b/docs/reveal.js deleted file mode 160000 index 249f013..0000000 --- a/docs/reveal.js +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Subproject commit 249f0139598b20d02263b81a76f1ff87f8e74225 diff --git a/index.html b/index.html deleted file mode 100644 index 414b5a7..0000000 --- a/index.html +++ /dev/null @@ -1,294 +0,0 @@ - - - - -Szimuláció RBBGCMuso-val - - - - - - - - - - - -
-
-

Szimuláció RBBGCMuso-val

Hollós Roland

2018. 09. 27

-
-
- -
- -
-
-

1 Bevezetés

-
-
-
-
-

2 Kérdésfeltevés

-
-
-
-
-

3 RBBGCMuso használata

-
-
-
-
-

3.1 devtools telepítése

-
- -
install.packages("devtools")
-
-
- -
-
-

3.2 RBBGCMuso telepítése

-
- -
devtools::install_github("hollorol/RBBGCMuso/RGBBCMuso")
-
-
-
-
-

3.3 csomagok betöltése, munkakönyvtár beállítása:

-
- -
library(RBBGCMuso)
-library(ggplot2)
-
-
- -
-
-

3.4 futtatás előkészítése: setupMuso()

-
- -
beallitasok <- setupMuso()
-
-
- -
-
-

3.5 modellfuttatás: calibMuso()

-
- -
kimenet <- calibMuso(settings = beallitasok,skipSpinup=FALSE)
-kimenet[1:6,1:2]
-
-
- -
-
-

3.6 kimeneti adatok ábrázolása (első verzió)

-
- -
plot(kimenet[,"daily_gpp"])
-
-
- - -
-

daily_1.png -

-
- -
-
-

3.7 egy kicsit cicomázva:

-
- -
par(mar=c(5,5,4,4))
-plot(y=kimenet[,"daily_gpp"],
-     x=as.Date(rownames(kimenet),"%d.%m.%Y"), xlab="Days",
-     ylab = expression(paste("daily GPP [",kg[C],m^-2,"]")),
-     type="l", col="blue", lwd="1.8")
-
-
- - -
-

daily_2.png -

-
- -
-
-

3.8 Mindez sokkal egyszerűbben

-
- -
plotMuso(variable="daily_gpp")
-
-
- - -
-

daily_3.png -

-
- -
-
-

3.9 Egy apró javítás

-
- -
plotMuso(variable="daily_gpp")+
-    labs(y=expression(paste("daily GPP [",kg[C],m^-2,"]")))
-
-
- - -
-

daily_4.png -

-
- -
-
-

3.10 musoMappingFind()

- -
-
-

3.11 musoMappingFind()

-
- -
musoMappingFind("yield")
-
-
- - - - --- -- - - - - - - -
3037cum_yieldC_HRV
- -
-
-

3.12 Nézzük meg, hogy hogyan változott a termés 2013 és 2017 között!

-
- -
plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+
-    labs(y=expression(paste("yield [",kg[C],m^-2,"]")))
-
-
- - -
-

yield_base.png -

-
- - -
-
-

3.13 Mentsük el az alapábránkat!

-
- -
termesAlap <- plotMuso(variable="cum_yieldC_HRV")+
-    labs(y=expression(paste("yield [",kg[C],m^-2,"]")))
-
-
- - - - -
-
-

3.14 Mentsük le a LAI-t is

-
- -
LAIAlap <- plotMuso(variable="proj_lai")+
-    labs(y=expression(
-             paste("Levélfelületi index ",over(m^2,m^2))))
-LAIAlap
-
-
- - -
-

lai_base.png -

-
-
-
-
-
- - - - - -